不管怎么说，结果己经定了下来。当然商毅也早就做好了被参政院表决通过的准备，就算是被表决通过，商毅也不打算退让，也要强行通过。因为商毅十分清楚，只要自己坚持不动摇，反对的声音就会慢慢自动消失，而学生们也都会去老老实实学习这些自然科目，毕竟十年寒窗苦读，不就是为了金榜提名的那一刻吗？能够真正坚持自己学术原则的人，总是少数，而等考过几次之后，就算再有人反对，也没有用了。
而这时在前次战役中抓到的绍武、永安两个朝廷的皇帝朱聿和朱以海，以及皇室成员，主要大臣一共有一百多号人，也都押送到了南京。
商毅下令，将朱聿和朱以海，以及他们的家人都送到孝陵去给朱元璋守坟，实际就是把他们的活动限制在孝陵的范围之内，等于的变向的监押。并且平时付责一些打扫卫生之类的工作。因为商毅并没有禁止明朝的遗臣去参拜孝陵，但疤熘豢乓桓鍪背降氖奔洹Ｒ虮仍谡庖桓鍪背侥冢祉茬、朱以海和他们的家人都将限制行动，不许和外人接触。
在中国历史中，对新兴王朝对前朝皇室的态度如果是大一统王朝，往往比较宽容，一般都会留着养起来，在有些王朝，还比较优待，而如果是分裂时期，则比较严厉，往往会斩尽杀绝。当然元清两朝是例外，因为是异族入侵，由其是清朝，基本将明室的后裔全部都杀光。
商毅并不是一个嗜杀的人，除非是需要立威的时候，一般对俘虏都不会滥杀，顶多就是去做苦工。而且也分别对待，满族、还有曰本、朝鲜、荷兰这外籍俘虏都是去开矿，或是开山石；而汉族俘虏，还比较优待，一般是开垦荒地，或是修路，在干了几年苦工之后，还会释放。
因此商毅也不打算对明朝的后裔下手，而且商毅也并不认为，朱聿和朱以海这些人能够翻得起多大的浪来，毕竟明朝己经是不得人心，注定无法再恢复了。杀了明朝的后裔，只不过是对自己不自信的表现。只不过现在还没有实现全国的统一，才先暂时将他们监禁起来，等商毅统一了全国，统治稳定下来之后，早晚都会将他们释放。而绍武、永安两个朝廷的其他主要大臣，也是一样。当然前提是他们都要老实的接受监禁。
等朱聿、朱以海以及家人安定下来之后，朱啤⒅婕姐妹也联名送来一些生活用品，向他们表示了慰问，并且也告戒他们，不要再有其他的妄想，老老实实的在孝陵里为太祖皇帝守陵。
其实朱聿、朱以海都不是胸有大志的人，在路上也是提心吊胆，生怕自己到达南京，就会被商毅所杀，但到了南京之后，被安排到孝陵居住，虽然是被监禁，但至少也表示商毅没有杀他们的意思。而且朱啤⒅婕姐妹也送来物品，更是让他们安下心来。因为朱聿、朱以海都知道，朱圃缂壕薷松桃悖敲凑庖簿痛碜派桃愕囊馑肌Ｒ虼艘簿桶残牡脑谛⒘昀镒∠铝恕
虽然他们的活动被限制在孝陵内，但孝陵的占地面积很大，不在南北京的紫禁城之下，因此并没有拘束的感觉，而且疤斓囊骋捕脊┯Φ帽冉铣渥悖淙槐炔簧纤堑被实鄣氖焙颍膊凰悴睿耙徊投加芯朴腥猓褂惺绷罴窘诘氖呃场６疤齑蛏ㄎ郎裁吹模簿偷扔谑庆蚜渡硖辶耍虼肆郊胰嗽谛⒘昀镒×思柑熘螅醯谜庋纳钜膊淮恚貌蛔耪ǘ崂嵝牡醯ā
而那些一起被送到南京的绍武、永安两个朝廷的其他主要大臣，则都送到南京郊外的一家劳改农场里，和抓到的俘虏们进行劳动改造，其中还一些他们认识的士兵，当疤齑邮乱恍┘虻サ呐┗睿谂┏±锏绞强梢宰杂苫疃一垢翘峁┮恍┦榧椭谢北ā
这样的处理结果，到这些大臣们有些意外，有不少大臣在来南京之前，是都怀着必死的决心，也有几个人甚致还准备在见到商毅之后，大骂他几句，也有人写好了遗诗，在受刑前作慷慨激昂将的念出来，总之都巳经做好了尽忠取义的准备。
当然也有一部份人心里在盘算，传闻商毅素来礼贤下士，爱材如命，会不会来招揽自己，那么自己也应该注意火候分寸，差不多的时候，就装出被感动的样子来，投到南京政fu中去。有些人还在演练自己在被感动的时候，应该是什么样子，说什么话，是作对天长叹状，还是泪流满面，是该说“真圣b之主也” 还是说“非臣不忠，实在是势不可违”。
但谁也没有想到，那知到了南京之后，商毅压根就]理自己，直接仍到农场里进行劳动改造。每个人都在这种不知所措的心态中，开始了自己的新生活。