妙常看着这个疯子一样的人时怒时喜，小心肝儿常被他弄得一颤一颤地不上不下。她只好默默地在旁磨墨，有时也倒点茶水，颇有一番红袖添香的味道，可李玄却视而不见。
李玄沉浸在自己才能体会得到的沉思之中，有时也会拿起笔来，在纸上刷刷地乱写一通。有时却掩卷深思，像一座雕塑般长时间地出神。
妙常趁着他出去散步或尿遁之时，偷偷地看那些纸上的文字：
天人合一，混同主客观，要不得。天是自然，是研究客体。人是主体，如何能混为一谈。自然和人要分开研究，混在一起，是玄学，是体验，是内省，是模糊的根源。天与人不能合一，而是要合谐！对，天人合谐比天人合一好！
无中生有，讲的是宇宙起源，跟大爆炸理论相合。有道理！
元气，组成一切的基本物质，像原子论。但元气的运动形式、规律，模糊！
道体，本原，规律。三者关系。
感应？物类相感，是磁场，或者场论？
种有几，值得研究。物种，基因。
化生：是变化的理论，多指生物。也可推及无生命现象。
象数：数学模型？但前提有错，不可用。
机，机之变，否泰，损益，盛衰。机字，值得深思。观机，应机，执行，盗机，发机。造化之机？
观天之道，执天之行，总纲。
逆天与顺天，人与自然关系。
看到这些东西，妙常觉得真是不可思议。对她来说，简直是乱七八糟，毫无条理，这根本不是在读经治学，这是在信笔涂鸦！
不过，这字到是写得不错的，二王体的行草。幸亏李玄练过，不然，妙常真的要怀疑他是否读过书了。
妙常不是没有读过道经，也跟父兄师长学过典籍，当时人治学，都是逐字逐句地解释经文原义，再参考历代各家的注文，才能完全理解。而李玄这种方法，对她来说，实在是太过骇人听闻了！
妙常没来由地担起心起来。她开始怀疑李玄是不是真的要坐下来读书！
可是李玄依然故我，如痴如狂，常常沉思半天，或者忽然又拉过纸来，急写一通。
后来，李玄便请妙常把先秦诸子的书通通搬了出来，重新又找了一些书来读，像《墨经》、《吕氏春秋》等。
直到第十天，他才开始奋笔疾书，写了一页又一页。
妙常看时，却见第一张纸上写着书名：《造化指南》。
妙常暗暗心惊，这人，真是语不惊人死不休啊。这书名起得，口气也太大了吧。
李玄一直写了三天，总算把这本只有十来页的《造化指南》写完。
掷了笔，他让妙常把埋头读经的苏柯叫来，然后笑吟吟地对二人说：“你们先看看，如果能懂，说明我的心血没白费！如果不懂，当然可以辩论！”
苏柯半信半疑地开始读李玄这本新作，这小玄子，他可是太清楚了，几个月前，还对丹经一无所知，如今都敢自己写书了？难道他真的是神人不成！
可是才看了几页，他的面色却变得凝重起来。一言不吭地读下去，读完一页，便顺手递给眼巴巴等着的妙常。
妙常则是看得似懂非懂，把一双秀眉蹇成一团，这书，显然超出了她的理解范围。
李玄这本《造化指南》一共分为十章：天人、物理、变化、质测、通几、类比、推理、归纳、数理、置疑。
其实李玄写这本书的本意，就是建立一种较为科学的方法论。但不可避免地要涉及到古人对自然的认识。
在天人章中，他强调了天与人的分离，而不是合一。天是自然万物，人是万物之灵。人要知天地自然之道，必然要独立于天地之外，而不是混而为一。他把老子道德经中的话拿来，赋以新的含义。比如“独立守一”，便是指人可以独立于天地之外，以独立的精神来研究自然，但人最终还是要与自然合谐相处。
在物理章中，他又引庄子的话，“天地有大美而不言，四时有明法而不议，万物有成理而不说。圣人者，原天地之美而达万物之理。”但他却提出，万物各自有理，人要“齐物”，要分开研究万物的道理，而不是混为一谈。
变化章则举了许多炼丹术的例子，比如“曾青得铁则化为铜”，说明物质不是一成不变的，研究变化之道，才能真正地通晓物理。