如何研究呢？这就是“质测”的内容，质测就是对万物进行观察，区别其名实和性质，用实际测量的方法，验证的方法，才能找出万物之理。
而通几章则根据庄子说的“种有几”，来解释生物的变化，是因为生物内部的“几”，有了这个“几”，才能不断地化生，这里实际包含了生物基因以及进化的思想。
类比、推理、归纳等章，则是根据古书，特别是墨家的思想，简单地总结了比类取象，因果关系，现象归纳等基本方法。
在“机发”章里，则分了观机、应机、执机、盗机、发机五节，其中大量引用了《阴符经》和《天机经》的内容，说明研究物理，首先要观察，然后是找到相应的质测方法，抓住事物的“机”，掌握了机，才能达到“执天之行”的效果。其实这是抓住事物的主要本质，研究事物的内在动因。也探讨了人与自然的关系，不仅有顺应自然，还有“反者道之动”，即逆自然而动，在一定范围内改变自然。
数理章则针对周易象数之论，指出数本身没有神秘含义，无论是太极，阴阳，三才，四象，五行，六合，八卦，这些数跟象无关，数是用来演算的，而不是用来取象比类的。数理，就是算术之法，可以通过质测的方法，用数字的运算，来说明事物之理。
置疑章，则说明对天地万物，古往今来的怀疑，会导致人们更进一步地去“究万物之理”，怀疑精神，是研究天地自然的基本精神。包括这本《造化指南》，也只是一家之说，完全可以怀疑！
当然，李玄知道，以自己的哲学和科学水平，也许并不能让当时的人信服。但至少他要提出一种与当时主流思想不同的新的思想，只有求新，才能打破成规，引发更多的思想碰撞。
对于苏柯来说，这本《造化指南》完全颠覆了他的固有思想。不说天人合一，而强调天人分离，非仙非神，这是一个没有神仙圣灵的世界。不讲还丹入口，延命长生，却强调质测物理，研究变化之道。虽然如此，但却也同样引经据典，而且大部分都引用的是先秦诸子之说。
“此书奇而又奇，但又似是而非，我恐怕一下子也读不懂，但看上去好像也挺有道理。容我仔细看看，好好想想再论！”苏柯老老实实地道。
“其实你只要读懂最后一章，凡事都带个疑问，就算读懂了！”李玄笑道。
苏柯沉思良久，还是摇摇头，却忽然笑道：“小玄，此书一出，恐怕以后你就有一个新名字了，叫‘玄玄子’。”
“玄玄子？不好，不好，叫玄元子吧，那样才像个有道高人啊。”
“你不要命了啊，玄元皇帝是谁啊？你敢叫玄元子？”苏柯哈哈大笑起来。
李玄这才醒悟，老子才是玄元皇帝啊，不过，是那个老子，不是老子我！不过，老子也姓李！哈哈……
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